Сергей Пускепалис родился в Курске в 1966 году. Его отец литовец, отсюда такая необычная фамилия актера, а мама – из молдавских болгар. Вскоре семья уехала на Север, летом мальчик часто гостил с отцом в Каунасе, где жила его бабушка Данута.
Когда парню было 14, семья переехала в Саратов. Родители мечтали, что их сын станет летчиком, он же мечтал стать актером — сначала занимался в детской театральной студии «Муравейчик», затем закончил Саратовское театральное училище. Недолго был женат на студентке того же училища, ныне Заслуженной артистке Эльвире Данилиной.
После училища Пускепалис три года служил на Северном флоте. После службы в армии служил в Саратовском театре. На одной из встреч с выпускниками «Муравейчика» встретился с Еленой Петровой, с которой был знаком в детстве. Девушка в свое время так и не смогла поступить в театральное училище, она стала гидрогеологом.
Сергей с первого взгляда влюбился в повзрослевшую соученицу. Вскоре они поженились, в 1992 году родился их сын Глеб. Он пошел по стопам отца, снимается в кино, нередко в одних фильмах с отцом. Впрочем, если быть совсем точными, то актерскую профессию сын, конечно, выбрал глядя на отца, но сниматься в кино он начал раньше, чем Сергей, который долгое время оставался именно театральным актером.
Сергею было 32 года, когда он решил стать режиссером и снова пошел учиться, поступив в РАТИ, Пускепалис сначала жил в Москве сам, потом перевез жену и сына в столицу, Елена также нашла там работу. Он окончил режиссерский факультет РАТИ в 2001 году, с этого времени Пускепалис начал свою деятельность в качестве театрального режиссера.
Его сын Глеб Пускепалис рано начал сниматься в кино, на кастинги его водила мама Елена Пускепалене, когда мальчику было лишь 10 лет, его пригласили на главную роль в фильм «Коктебель».
В 2003 году, после выхода ленты сына, начал играть в кино и отец, хотя его режиссерский дебют в кинематографе состоялся намного позже. В 2015 году Пускепалис поставил фильм «Клинч» — экранизацию одноименной пьесы российского драматурга Алексея Слаповского.
Дебют оказался удачным, фильм стал обладателем нескольких призов на кинофестивалях, в том числе, получил «Рубинового Феникса». Сергей Пускепалис ставит спектакли в разных городах страны, живет же он с семьей в Железноводске, поясняя тем, что им с женой жить в столице некомфортно.
